高级职称
首页 >> 师资队伍 >> 高级职称 >> 马闯
 

马闯

作者:wangyoucai    来源:     发布日期:2015-09-22     浏览次数:

     

  

一、个人简介


马闯,男,1982年6月生,湖北随州人,西北农林科技大学教授、博士生导师。2004年6月本科毕业于华中科技大学物理系应用物理专业,随后保送至华中科技大学生命科学与技术学院系统生物学系,研习基于基因组学数据的生物信息学大规模数据挖掘技术。2010年3月获华中科技大学生物信息技术专业博士学位,同年6月赴美国南加州大学洛杉矶儿童医院(Childrens Hospital Los Angeles, University of Southern California)开展了为期一年的博士后研究,研究方向为高通量转录组学数据的生物信息学分析算法研究及应用。2011年7月转入美国亚利桑那大学植物科学系(School of Plant Sciences, University of Arizona)继续从事博士后研究,研究方向拓展至植物基因组学、转录组学和系统生物学,以及植物领域的大数据分析。2014年被聘回国,在西北农林科技大学生命科学学院工作至今。


二、研究方向


1.高通量测序数据(包括基因组、转录组、外显子组以及小RNA等)的大规模分析,以及相关生物信息学分析算法的研发。


2. 生物学网络的构建及其在植物系统生物学中的应用研究。


3. 人工智能、Gini方法体系等先进技术和理论在植物学领域中的应用研究。


4. 农作物逆境胁迫分子机理的生物信息学研究。


5. 植物领域大数据分析的理论、方法和技术研究。


招生信息:接收本科生6~8人/年进行科研培训,招收硕士生、博士生和博士后。有意者请EMAIL联系。


三、主持及参加项目


主持西北农林科技大学高层次人才基金项目“基因组学数据生物信息挖掘平台的构建及应用(2014年~2019年)”。


曾作为主要研究人员参加美国国家自然科学基金项目“Gini-based methodologies to enhance network-scale transcriptome analysis in plants”(DBI-1261830)、美国比尔及梅琳达·盖茨基金会项目、中国国家科技基础条件平台项目,以及中国国家自然科学基金等多个项目。


四、主要学术成果


1. 研发了rsgcc,mlDNA以及KGBassembler等多款生物信息学软件。


2. 参与编著《生物信息学》教材一部。


3. 在Trends in Plant Science, The Plant Cell, Plant Physiology以及Bioinformatics等植物领域和生物信息学权威期刊上发表论文多篇。 部分论文如下:


[1]


Ma C, Zhang HH, Wang XF. Machine learning for Big Data analytics in plants. Trends in Plant Science, 2014, DOI:?http://dx.doi.org/10.1016/j.tplants.2014.08.004.


[2]


Ma C, Xin MM, Feldmann KA, Wang XF. Machine learning-based differential network analysis: a study of stress-responsive transcriptomes in Arabidopsis. The Plant Cell, 2014, 26(2): 520-537.


[3]


Ma C, Wang XF. Application of the Gini correlation coefficient to infer regulatory relationships in transcriptome analysis. Plant Physiology, 2012, 160(1): 192-203.


[4]


Ma C, Chen H, Xin MM, Yang RL, Wang XF. KGBassembler: A karyotype-based genome assembler for Brassicaceae species. Bioinformatics, 2012, 28(23): 3141-3143.


五、联系方式


通讯地址:陕西杨凌西北农林科技大学生命科学学院


邮编:712100


Email: chuangma2006@gmail.com


Website: http://bioinfo.nwafu.edu.cn/

版权所有:  西北农林科技大学生命学院    地址:陕西杨凌农业高新技术产业示范区西农路22号  邮编:712100

主管领导:徐海            技术支持:艾特网络